Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2025620354 Российская Федерация. «Массив данных молекулярной генетической экспертизы племенной продукции холмогорских быков-производителей по микросателлитным локусам (STR-маркерам) для организации селекционно-племенной работы с генофондной породой» : заявл. 09.01.2025 : опубл. 21.01.2025 / А. Е. Калашников, Л. А. Калашникова, В. П. Прожерин, В. Л. Ялуга ; заявитель Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Федеральный исследовательский центр комплексного изучения Арктики имени академика Н.П. Лаверова Уральского отделения Российской академии наук. (pdf, EDN FCJUWI, eLIBRARY ID: 80409157).
Монографии
Технологические и генетические аспекты производства высококачественной говядины: по материалам Республики Башкортостан / Т. А. Седых, Л. А. Калашникова, Р. С. Гизатуллин [и др.]. – Уфа : Башкирский НИИ сельского хозяйства УФИЦ РАН, БГПУ им. М. Акмуллы, ФГБОУ ВО Башкирский ГАУ, 2024. – 250 с. – ISBN 978-5-605-17008-2. (EDN HSLLRM, eLIBRARY ID: 67256679, pdf)
Методические и учебные пособия
Племенная работа с холмогорской породой скота / И. М. Дунин, Р. К. Мещеров, Л. А. Калашникова [и др.] ; Ответственный за выпуск: Н.С.Никулкин, с.н.с., к.с.-х.н.. Том 33. – Московская обл., Лесные Поляны : ФГБНУ ВНИИПлем, 2019. – 72 с. – ISBN 978-5-87958-388-5. (eLIBRARY ID: 41506138, EDN: DKRWSN)
Дунин И.М., Новиков А.А., Калашникова Л. А., Калашников А.Е., Гладырь Е. А., Бурмистрова Л. А., Бородачев А.В., Николенко А.Г.,Ильясов Р. А., Туктаров В.Р., Бойко Е. Г., Удина И.Г. Стандартные методы генетической идентификации, определения достоверности происхождения и бонитировки пчелиных семей. // Методические рекомендации. 2021.- ФГБНУ ВНИИплем.- С.1-78. (Pdf, приложение 1, DOI: 10.13140/RG.2.2.24373.76004) (EDN: FHQBBQ, eLIBRARY ID: 48080581 ) (кр. содержание)
Дунин И.М., Тяпугин С.Е., Голубков А.И., Калашников А.Е., Калашникова Л.А., Захаров В.М., Новиков А.А., Щегольков Н.Ф., Дунин М.И., Přibyl J., Ахметов Т.М., Загидуллин Л.Р., Шайдуллин Р.Р. Формирование моделей оценки племенной ценности животных // Методическое пособие. 2021.- ФГБНУ ВНИИплем. С. 1-33. (Pdf, DOI: 10.13140/RG.2.2.17570.50885, EDN: AZJDKJ, eLIBRARY ID: 47151739) (кр. содержание)
Тяпугин С.Е., Новиков А.А., Калашников А.Е., Калашникова Л.А.,Захаров В.М., Дунин М.И. Форматирование и хранение результатов генетической идентификации и экспертизы племенной продукции в геномной селекции животных // Методическое пособие.- 2021.- ФГБНУ ВНИИплем.- С.1-32. (Pdf, EDN: BPAXKH, eLIBRARY ID: 50474712) (кр. содержание)
Дунин И.М., Тяпугин С.Е., Пржибыл Й., Калашников А.Е., Щегольков Н.Ф., Захаров В.М., Калашникова Л.А., Дунин М.И., Ахметов Т.М., Загидуллин Л.Р., Шайдуллин Р.Р. Оценка племенной ценности сельскохозяйственных животных и ее использование в селекционной практике. Методическое пособие.- 2021.- ФГБНУ ВНИИплем.- С.1-73. (Pdf, EDN: QNYIJF, eLIBRARY ID: 47929912) (кр. содержание)
Шичкин Г.И., Калашников А.Е., Шайдуллин Р.Р., Калашникова Л.А., Захаров В.М., Ахметов Т.М., Тюлькин С.В., Загидуллин Л.Р., Щегольков Н.Ф. Система селекции крупного рогатого скота на повышение естественной резистентности // Методические рекомендации.- Казань, 2022 г.,- С. 1-49. (DOI: 10.13140/RG.2.2.27038.31048, EDN: UVZFLN, eLIBRARY ID: 88499647, pdf)
Методические рекомендации по стандартным методам хромосомного анализа / А. А. Новиков, А. Е. Калашников, Р. Р. Шайдуллин [и др.]. – Казань : Казанский государственный аграрный университет, 2024. – 32 с. – ISBN 978-5-9222-1855-9. (EDN LHPSRZ, eLIBRARY ID: 79670768, pdf)
Методические рекомендации по стандартным методам генетической идентификации и оценке достоверности происхождения животных (издание второе, дополненное) / Л. А. Калашникова, А. А. Новиков, А. Е. Калашников [и др.]. – Издание второе, дополненное. – Лесные Поляны : Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела, 2025. – 168 с. (pdf, EDN VSWGXE, eLIBRARY ID: 82757002) - прил КРС 1, 2, кабаны (дом свиньи) 3, 4, псовые 5, пчелы, осы и шмели 6, лошади 7, козы 8, оленевые 9, верблюдовые 10, кошачьи 11, стандарт идентификации обязательный перечень SNP GenoEx (NGS, чипы) 12, 13, TOP формат данных для чипов 14, перечень машинерия PCR, NGS, чипы, стандарт ICAR 15, перечень лабораторий аккредитованных 16, перечень центров интерпретации аккреитованных 17, обязательные инструкции CorDiz 18
Другие методические и учебные пособия
Временная инструкция по генетическому контролю достоверности проихсождения сельскохозяйственных животных /В.Я. Мещеряков, И.С. Курнишков , В.В. Павличенко, П.Ф Сороковой, С.П. Безенко, С.А. Казановский, Р.М. Дубровская - Министерство сельского хозяйства СССР, 1985. - 40 с. (pdf)
Методические рекомендации по использованию групп крови для индивидуального подбора крупного рогатого скота /С. К. Охапкин, В. М. Захаров, А. И. Хрунова, Н. М. Жукова, Г.В. Телешева, В. И. Ивлев – Лесные Поляны : ФГБНУ Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела Министерства сельского хозяйства Российской Федерации, 1996. – 37 с. (pdf)
ДНК-технологии оценки сельскохозяйственных животных : методические указания / Л. А. Калашникова, И. М. Дунин, В. И. Глазко [и др.]. – Лесные Поляны : Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела Минсельхоза России, 1999. – 148 с. – ISBN 5-87958-119-5. (pdf, EDN ETGPRD, eLIBRARY ID: 83111391)
Концепция организации работы по генетической экспертизе племенной продукции (материала) в животноводстве Российской Федерации / С. А. Данкверт, В. В. Шапочкин, Х. А. Амерханов, И. М. Дунин, А. А. Новиков – Лесные Поляны : ФГБНУ Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела Министерства сельского хозяйства Российской Федерации, 2001. – 19 с. (pdf)
Правила генетической экспертизы племенного материала свиней : Правила для специалистов лабораторий иммуногенетики и работников племобъединений Российской Федерации / И. М. Дунин, А. А. Новиков, Н. И. Романенко [и др.]. – Москва : Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела Министерства сельского хозяйства Российской Федерации, 2003. – 51 с. (pdf, eLIBRARY ID: 78001449, EDN CVWAMC)
Использование ДНК-диагностики для улучшения качества молока коров холмогорской породы / Л. А. Калашникова, Т. Б. Ганченкова, Я. А. Хабибрахманова [и др.]. – Москва : ФГБНУ"Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела", 2009. – 34 с. – ISBN 978-5-87958-267-3. (EDN TRTUDV, eLIBRARY ID: 23386230)
Система генетического мониторинга племенных стад сельскохозяйственных животных : Методическое издание ФГБНУ ВНИИплем по заказу Минсельхоза России / А. А. Новиков, А. Н. Завада, Л. А. Калашникова [и др.]. – Лесные Поляны : ФГБНУ Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела Министерства сельского хозяйства Российской Федерации, 2011. – 16 с. (pdf, eLIBRARY ID: 73534713 , EDN JEOTHJ )
Правила ведения учета данных в племенном свиноводстве / отв. за выпуск Х.А. Амерханов // Минсельхоз России. – 2012. – 39 с. (pdf, EDN PDVUMD, eLIBRARY ID: 17997450)
Калашникова, Л. А. Геномная селекция крупного рогатого скота / Л. А. Калашникова, Я. А. Хабибрахманова. – Лесные Поляны : ФГБНУ Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела Минсельхоза России, 2013. – 31 с. – ISBN 978-5-87958-306-9 (pdf, EDN NDHVFA, eLIBRARY ID: 82341074)
Подтверждения породной принадлежности животных на основе данных иммуногенетического и ДНК анализов / А. А. Новиков, Л. А. Калашникова, Н. Г. Букаров [и др.]. – Лесные Поляны : Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела, 2019. – 47 с. – ISBN 978-5-87958-329-8. (pdf, EDN ZCRFAS, eLIBRARY ID: 82801683)
Рекомендации по геномной оценке крупного рогатого скота : Методические рекомендации / Л. А. Калашникова, Я. А. Хабибрахманова, И. Ю. Павлова, Т. Б. Ганченкова. – Лесные Поляны : Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела Министерства сельского хозяйства РФ, 2015. – 36 с. – ISBN 978-5-87958-306-9. (pdf, EDN DEVGOX, eLIBRARY ID: 75050218)
Рекомендации по использованию методов генетического мониторинга в селекции крупного рогатого скота и свиней : методические указания / А. А. Новиков, Л. А. Калашникова, М. С. Семак, А. И. Хрунова. – Лесные Поляны : Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела, 2015. – 24 с. – ISBN 978-5-87958-339-7. (pdf, EDN EBQGZC, eLIBRARY ID: 83111386)
Методические рекомендации ведения национальной системы генетической экспертизы и мониторинга племенной продукции сельскохозяйственных животных / А. А. Новиков, Л. А. Калашникова, Н. Г. Букаров [и др.]. – Лесные Поляны : Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела, Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела, 2020. – 24 с. (pdf, EDN CUKAVL, eLIBRARY ID: 82823205)
Методические рекомендации по использованию генотипа А2А2 бета-казеина в селекции молочного скота для получения молока А2 : Методические рекомендации / Л. А. Калашникова, Я. А. Хабибрахманова, Н. В. Рыжова [и др.]. – Лесные Поляны : Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела Министерства сельского хозяйства Российской Федерации, 2022. – 20 с. – ISBN 978-5-87958-306-9. (pdf, EDN KJNIWG, eLIBRARY ID: 65288729)
Планы селекционно-племенной работы
Захаров, В. М. План племенной работы со стадом крупного рогатого скота Племенного завода по разведению крупного рогатого скота холмогорской породы - Печорский тип / В. М. Захаров, А. Е. Калашников ; Общество с ограниченной ответственностью Племхоз «УХТА-97» на период с 2022 по 2032 гг.. – Шудаяг : Общество с ограниченной ответственностью Племхоз «УХТА-97», 2023. – 106 с. –(EDN KNTIQA, eLIBRARY ID: 59464071)
Отчеты НИОКР
Калашников А.Е., Семак М.С. Проведение исследований по разработке методических подходов по повышению естественной резистентности крупного рогатого скота на основе оценки их иммуногенетического статуса (Этап 1. Проведение исследований по разработке методических подходов по повышению естественной резистентности крупного рогатого скота на основе оценки их иммуногенетического статуса) / Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела. – Лесные Поляны, 2021. – 43 с. – Номер гранта: НИОКТР № 121042900064-3. – Номер госрегистрации: 082-00221-21-00. (pdf, EDN: OCKQVU, eLIBRARY ID: 54691373)
Козанков А.Г., Калашников А.Е., Глушко Л.А., Чешигин М.Е., Калашников В.Е. Изучение влияния генных структур крови в детерминации повышенной жизнеспособности крупного рогатого скота и разработка методов их использования в селекции животных на повышение жизнеспособности (Этап 2. Изучение влияния генных структур крови в детерминации повышенной жизнеспособности крупного рогатого скота и разработка методов их использования в селекции животных на повышение жизнеспособности) / Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела. – Лесные Поляны, 2022. – 61 с. – Номер гранта: НИОКТР 122041900193-2. – Номер госрегистрации: 122041900193-2. (pdf, eLIBRARY ID: 51735542, EDN: CWHINQ)
Калашникова Л.А., Калашников А.Е., Глушко Л.А. Проведение исследований по разработке методических подходов к анализу структуры и функции генов иммунитета крупного рогатого скота с использованием популяционной и структурной геномики (Этап 1. Проведение исследований карты генома крупного рогатого скота и предсказания структуры генов врождённого иммунитета и способов их транскрипционной регуляции) / Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела. – Лесные Поляны, 2023. – 34 с. – Номер гранта: НИОКТР № 123030600086-3. (pdf, eLIBRARY ID: 88969521, EDN: AOEBPT)
Калашникова Л.А., Калашников А.Е., Глушко Л.А. Проведение исследований по разработке методических подходов к анализу структуры и функции генов иммунитета крупного рогатого скота с использованием популяционной и структурной геномики (Этап 2. Проведение исследований вариантов структуры и регуляции генов врождённого иммунитета крупного рогатого скота) / Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела. – Лесные Поляны, 2024. – 78 с. – Номер гранта: № НИОКТР 124021900122-2. (pdf, eLIBRARY ID: 88969519, EDN: SWVXHI )
Калашникова Л.А., Калашников А.Е., Калашников В.Е., Ларченкова В.С., Глушко Л.А. Проведение исследований по разработке методических подходов к анализу структуры и функции генов иммунитета крупного рогатого скота с использованием популяционной и структурной геномики (Этап 3. Анализ генетической структуры промоторов генов рецепторов врожденного иммунитета крупного рогатого скота) / Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела Минсельхоза России. – Лесные Поляны, 2025. – 49 с. – Номер гранта: НИОКТР № 125052106295-8. (pdf, eLIBRARY ID: 87564962, EDN: OJPROC)
«Проведение исследований полиморфизма генов-маркеров мясной продуктивности у красно-пестрого скота с целью селекции на получение высококачественной говядины, 2023, исполнитель, Рег. № НИОКТР 123030600085-6 (pdf, )
Калашникова Л.А., Хабибрахманова Я.А., Рыжова Н.Г., Багаль И.Е., Ганченкова Т.Б., Павлова И.Ю., Калашников А.Е., Сенина Р.Ю., Макаров Д.О., Глушко Л.А., Калашников В.Е., Чешигин М.Е. Проведение исследований по генетической характеристике голштинского скота отечественной селекции на основе STR-маркеров генома с целью разработки критериев определения породной принадлежности животных / Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела. – Лесные Поляны, 2023. – 40 с. – Номер гранта: НИОКТР 123030600068-9. (pdf, eLIBRARY ID: 54082343, EDN: GQHATW)
Калашникова Л.А., Хабибрахманова Я.А., Рыжова Н.В., Багаль И.Е., Ганченкова Т.Б., Павлова И.Ю., Калашников А.Е., Тетюркин Е.А., Семак М.С., Сенина Р.Ю., Макаров Д.О., Глушко Л.А., Калашников В.Е. Проведение исследований по генетической характеристике отечественных пород крупного рогатого скота на основе STR-маркеров генома с целью разработки критериев определения породной принадлежности животных (Этап 1. Провести исследования по определению генетического профиля холмогорской породы крупного рогатого скота по STR-маркерам генома) / Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела. – Лесные Поляны, 2024. – 38 с. – Номер гранта: № НИОКТР 124021900122-2. (pdf, eLIBRARY ID: 88969493, EDN: LQVMAW)
Калашникова Л.А., Калашников А.Е., Хабибрахманова Я.А., Рыжова Н.В., Багаль И.Е., Ганченкова Т.Б., Павлова И.Ю., Тетюркин Е.А., Сенина Р.Ю., Макаров Д.О., Глушко Л.А., Калашников В.Е. Проведение исследований по разработке методов диагностики генетических заболеваний крупного рогатого скота (Этап 1. Изучение генетической природы и разработка методов диагностики генетически детерминированных заболеваний голштинского скота) / Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела. – Лесные Поляны, 2025. – 56 с. – Номер гранта: № НИОКТР 125052106291-0. (pdf, eLIBRARY ID: 88969515, EDN: XBNSXG)
Грант РНФ. Идентификация генов, участвующих в регуляции иммунной системы крупного рогатого скота / Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела». – Лесные Поляны, 2023. – Номер гранта: 23-26-00235. (eLIBRARY ID: 80610895, EDN: GAKDRG)
